音楽は人の心を照らす光――突如として、その『光』が世界から奪われる。空から黒い隕石『黒夜隕鉄』が降った夜、世界は様変わりした。黒い隕石から生み出された異形の怪物『Ｄ２』が、大地と人々を蹂躙し始める。Ｄ２は人の奏でる旋律に惹かれ、やがて『音楽』そのものが禁忌とされた。だが、その怪物に抗う者達が現れる。音楽を力とする少女達――『ムジカート』。彼女達は、人類史に残る偉大な歌劇、楽曲の楽譜（スコア）を身に宿し、Ｄ２を撃ち破る力とした。そして、彼女達を指揮し、導く『コンダクター』。2047年。Ｄ２との抗争によって荒廃したアメリカ。コンダクターの『タクト』は、ムジカート『運命』と共にニューヨークを目指して旅していた。音楽が失われた世界で、音楽を渇望する『タクト』。Ｄ２の殲滅を望むムジカート『運命』。二人の少年と少女が生み出す旋律は、歓喜かそれとも絶望か――

明浦路司がフィギュアスケートの世界に挑戦することを決めたとき、アイスダンサーになることは目標ではなかった。 しかし、本当のソロスケートの夢を追うには「始めるのが遅すぎた」ため、彼はそこに行き着いたのです。 何年もの間、彼はかつての野心の抜け殻であることに満足していましたが、ある少女に出会うまでは、自分の中に自分自身を見出していました。 スケートがしたくてこっそり練習していた小学5年生の結束いのりさんは、母親と一緒にレッスンを求めて司のリンクを訪れていた。 彼女は周囲から役立たずの烙印を押され、始めるには「遅すぎる」、他のスケーターに追いつくのは不可能だと言われた。 新たな信念と、他の情熱的なスケーターを自分と同じ道に歩ませたくないという思いから、つかさは指導の責任を引き受け、いのりをメダリストにすることを約束する。

ある昼下がり。夏休みを迎えたありすは、とある芸能事務所の一室にいました。そこで出会ったのは、学年も性格もてんでんばらばらの8人の少女たち。部屋の名前は『第3芸能課』。ホコリっぽい小さな部屋で、小さな女の子たちは夢見ます。ここから、私のアイドルとしての物語が始まるのね――。と、そこへ現れたのは王子様みたいに素敵なプロデューサー！……ではなく、プロデューサーになったばかりの小さな青年でした。やる気だけはある新人プロデューサーと、何もかもがこれからの少女たち。お仕事ってどうしてこんなに難しいものかしらと、悩み、次の日には笑って、手と手をつないで階段を登ります。ありすたちは、いつか見た夢のステージへ行くことができるのでしょうか？『アイドルマスター シンデレラガールズ』から生まれる、新たなストーリー。「――ねぇ、大きくなったら何になろっか！？」

2043年7月15日、各々のプレイヤーによって千差万別、否、“無限”のパターンの進化を辿る独自のシステムを有するダイブ型VRMMO＜Infinite Dendrogram＞が発売された。それまでのVRMMOが実現できず、技術的に不可能とされてきた要素を備えていた＜Infinite Dendrogram＞は瞬く間に一大ムーブメントとなって世界を席巻した。大学受験を終えて東京で1人暮らしを始めた青年・椋鳥玲二は、長い受験勉強の終了を記念して、かねてより兄に誘われていた＜Infinite Dendrogram＞を始めるのだった──。

高校１年生・白石純太には、誰にも真似できない性質があった。隣にいても気付かれない、毎日出席していても欠席だと誤解される——。彼は、存在感ゼロの"モブ"男子だったのだ。 それでも彼なりに慎ましく学園生活を送っていたのだが、ちょっぴり厄介なことが一つだけ。なんと同じクラスの"ヒロイン級"美少女･久保さんだけが、彼を見つけてはちょっかいを出してくるのだ。特別になれない"モブ"男子と、彼の前に現れた"ヒロイン"女子。 教室の隅から、青春は緩やかに色づき始めて——。誰だって、誰かの"特別"になれる。でもその感情に"恋"と名が付くには、まだ二人は少しだけ幼い。"ラブコメディ"の２歩手前、ヒロイン女子×モブ男子の思春期スイートコメディが幕を開ける。