宇宙空間に広がる夢の路線「ギャラクシーライン」を走るサファリレッシャーが、「シャドーライン」のナイル伯爵によって襲撃された。サファリレッシャーは切り離され、先頭車両のみが地球へ。エネルギーが不足しているため、このままでは宇宙へ帰ることができない。「ギャラクシーライン」消滅の危機――! しかしライトは、ある作戦を思いつく。

怪盗キッドから警視庁に犯行予告が届く。彼が狙うのは鈴木財閥の会長宅から見つかったロマノフ王朝の秘宝“インペリアル・イースター・エッグ”の新たな1個だった。鈴木会長から保護依頼を受けた探偵・毛利小五郎に同行し、コナンと蘭も会長宅のある大阪へと向かう。厳重な警備が敷かれる中、キッドは警察の裏をかく大胆な手口でエッグを盗み出すことに成功するが、ハンググライダーで逃走中に何者かに撃たれ、墜落してしまう。

昭和46年冬、水木は「ゲゲゲの鬼太郎」などの執筆で忙しい中、無理やりに休暇をとって、赤道直 下のニューギニアを旅した。水木は、昭和18年21歳の時に召集され、ニューギニアのラバウルに 送られた。当時ニューギニアは連合軍に島の半分を占領され、日本軍の敗色は濃厚。水木二等兵は最 前線の小隊に配属され、過酷な戦場を生き抜いた。以来、26年ぶりに踏むニューギニアの大地だっ た。そして、これがそもそものきっかけだった・・・。昭和47年となり、日々「鬼太郎」の締め切り に追われる水木の周りで不可解な事件が起きる。行きもしないレストランからは請求書が届き、連れ 込み旅館で水 木の姿を見かけたと編集者には言われる始末。おまけに水木の行く先々には、夢か幻 か、南方の象徴である"ハイビスカス"の花が咲き誇っている・・・。やが て水木は「何者かに押される 形」で、自身の戦争体験を漫画に描き始めた・・・。昭和18年、丸山二等兵(=水木)は、ニューギ ニアのバイエンにいた。ここは米軍と対峙する日本軍の最前線基地。初年兵として陣地構築の為、椰 子の木を運 び、穴を掘り、食料調達に働かされる日々だった。要領の悪い丸山は鬼軍曹にビンタを 食らう毎日だった。敵襲に備える日々の中で、加山二等兵は、行軍の最中、敵の銃弾を浴びて倒れた 。丸山は彼の小指を切って遺骨代わりにした。入隊前からの戦友・赤崎は敵の機銃掃射にやられた・・ ・。そして、漫画は否応なく、戦友たち皆が玉砕したあの"聖ジョージ岬"へと進んでいく。総員が「 玉砕」への道に向かわざるを得なかった、あの理不尽な出来事へと・・・。

ヘルヘイムの森とはまったく異なる世界の調査をすることになった葛葉紘汰 / 仮面ライダー鎧武は、シュウと名乗る少年に遭遇する。その時、本郷猛 / 仮面ライダー1号が現れてシュウを連れていってはならないと告げ、しかも紘汰をライダーと認めないと言い放つ。1号を始めとした昭和ライダーは何のために行動しているのか、紘汰には理解できなかった。 そんな中、紘汰はある理由から平成ライダー15人の力を結集しようと幾つもの世界を渡り歩いていた門矢士 / 仮面ライダーディケイドと接触。一連の事件はすべて地下帝国バダンが人類滅亡を画策した結果と語って力を貸す様に依頼するが、そこに再び昭和ライダーたちが現れ、バダンを生み出した根源は平成ライダーと主張。 平成ライダーと昭和ライダーの互いの主張は相容れず、遂に昭和ライダーは平成ライダーに戦いを挑む。 そして、平成昭和の区別なくライダーを倒す仮面ライダーフィフティーンの出現と烈車戦隊トッキュウジャーおよびキョウリュウレッド / ダイゴの参戦により、遂に平成ライダーと昭和ライダーの勝敗の行方が明らかになる。