シンタロー（『南国少年パプワくん』参照）の弟コタローの「秘石眼」の暴走によってパプワ島が崩壊して4年。「青の秘石」の呼びかけにより眠りから目覚めたコタローは、ガンマ団本部を抜け出して第二のパプワ島にたどり着くが、記憶喪失となっていた。 再び力が暴走することを恐れたパプワと、元ガンマ団特戦部隊で島の番人として残っていたリキッドは、記憶を思い出させないようにパンツに書かれていたコタローの「コ」の字にマジックで線を書き足し、コタローに自分の名前を「ロタロー」と思い込ませてしまう。 そしてロタローは島の奇妙な生物（ナマモノ）達と友達になっていく。コタローを取り戻すために現れたガンマ団の刺客達も、パプワやナマモノ達にすっかり振り回されてしまう。 その後コタローは記憶を取り戻し、入れ替わるようにシンタローが再びパプワ島に。そして、行方不明となっている「赤の秘石」を探し出すために、「青の秘石」の力で島ごと異世界に漂流することとなる。

16歳のまろんは、桃栗学園の新体操部に所属する一見フツーの女の子。 だが、実はジャンヌ・ダルクの生まれ変わりとして神の力を受け継ぎ、美しい物に潜む悪魔を封印し回収している怪盗ジャンヌだった。ジャンヌを捕らえようとする刑事の娘・都が仕掛ける罠を、準天使フィンと共にかいくぐり、回収している。ジャンヌの行動の究極的な目的は、太古より続く神と魔王との戦いに関わるものであった。 そんなある日、まろんのクラスにクールな美少年・稚空が転入してくる。彼の意味深な態度に、まろんは惑わされ始める。実は、稚空こそジャンヌのライバル・怪盗シンドバッドだったのだ！彼はジャンヌの行く先々に現れ、どちらが悪魔を回収するか勝負を挑んでくるのであった。謎の怪盗シンドバッドと刑事の娘・都を相手に、ジャンヌの「痛快・怪盗・ラブ・アクション」が今、幕を開ける！

坂の途中にある古い下宿・五地荘に越してきた青年・天和響。教師を目指す彼は、青鞜三ノ宮学院中等部に職を求めて乗り込むが、女尊男卑の学院長にきっぱり「我が校は女性教師しか採用致しません」と門前払いをくらう。途方にくれる響だが、大家のるるばあさんは彼に女装をさせ、見目麗しい「天和ひびき」にしてしまい…。

凛々しく素敵な男装の少女・天上ウテナは、生徒会副会長の西園寺と決闘することになってしまった。誘われるままに「決闘の森」に足を踏み入れたウテナを待っていたのは、見たこともない不思議な世界。そして、西園寺に寄り添う「薔薇の花嫁」と呼ばれる少女・姫宮アンシー。「世界を革命する力」をめぐる物語が始まる！

平凡な高校生・水城祐介の前に、女の子が落ちてきた。彼女の名はルージュ、記憶を失っていたが、魔界のプリンセスであった。 2人が奇妙な共同生活を始めると、やがて天界、魔界、人間界を巻き込む大事件へと発展していく…。

かつて軍事集団カブスの猛攻から逃げ延びた忍びがいた。数十年後、彼らは同士の無念を継ぎビャクロ再興を悲願に修行を重ねていた。一族秘伝の巻物を取り戻そうと旅立つ六人の前に、姫を狙う魔の手が忍び寄っていた…。

本に表紙と裏表紙があるように、世界にもまた裏の顔がある。そこでは市井の人々には垣間見ることすらできない闘いがある。そんな闘いに毎度毎度かり出される女がいる。女の名は読子。読子・リードマン。職業、非常勤講師。活字中毒の蔵書狂(ピブリオマニア)。年齢25歳。ひどい近視。しかし、その実体は裏の世界では“ザ・ペーパー”と恐れられる大英帝国図書館特殊工作部の秘密エージェントである。彼女の特殊能力は“紙使い”。紙を自在に操ることが可能な、紙に愛された女。今日もまた世界の変革を企む｢世界偉人軍団｣との闘いが待っている。彼女の手にする紙一枚に、世界の運命が委ねられている……