故郷のクリン星をワーラー帝国に滅ぼされたスピルバンとダイアナは、超時空戦艦グランナスカで地球へやってきた。時は流れ、ワーラー帝国はその魔の手を地球へと伸ばしてきた。城洋介とダイアナはグランナスカから発射されるクリンメタル超微粒子を“結晶”させたハイテククリスタルスーツに身を包み、地球を守るため、ワーラー帝国へと戦いを挑む。

仮面ライダーは世界征服をもくろむ悪の組織ショッカーに改造人間にされてしまった主人公が、その傷と悲しみを仮面で隠し人々の平和を守るために戦う

１９９９年、過度に発達した科学にハイテク犯罪が激化している日本。巧妙になっていく科学犯罪に対抗するため、警視庁の正木警視監は「警視庁特別救急警察隊ウインスペクター（ＷＳＰ）」を設立、市民の安全と平和を守る特別活動を開始した。隊長に選ばれたのは若干２３歳で警視正となった青年・香川竜馬。彼は「クラステクター」と呼ばれる強化服を「着化」し、飛行能力を持つウォルター、地上活動に長けたバイクルという２体のサポートドロイドと、情報収集を担当する藤野純子捜査官たちと共に、数々の事件を解決していく！