スティッチは自分がカウアイ島の町をムチャクチャに壊してしまう悪夢にうなされていた。リロに優しく慰められ、ひと安心するスティッチだったが、ある日、様子がおかしくなり暴れはじめてしまうのだった。スティッチの生みの親ジャンパは「スティッチの分子エネルギーが下がるほど悪い子になってしまい、エネルギーが切れたとき、永遠に動かなくなってしまう」という。自分を抑えきれなくなったスティッチはついにリロを傷つけてしまい、傷心とともに行く当てのない一人旅に出て行くのだった。

ハワイ・カウアイ島。両親を亡くした少女リロは、姉のナニと暮らすが、福祉局から養育環境を問題視され、施設へ送られようとしていた。そんなリロは奇妙な子犬をペットとして引き取り、スティッチと名づける。実はスティッチは宇宙人ジャンバ博士がひそかに作り上げたモンスターで、脱走して地球に逃げ込んで来たのだ。スティッチの捕獲のため、逮捕されたジャンバ博士とお目付け役の諜報員プリークリーが地球へと派遣されてくる。

原始時代。洞窟に暮らすクルード家の父グラグは、家族が過酷な世界で生き延びてこられたのは、《外の世界に出ないこと》という掟を守っているおかげと信じ、子どもたちにも固く外出を禁じていた。だが好奇心旺盛な長女イープはたびたび夜中に洞窟を抜け出し、あるとき初めて見る《火》を持った青年ガイと出会う。そんな矢先、大地震が起きて洞窟が崩壊、一家はガイの助けを借りながら、否応なく新天地を探す旅に出るはめになる。

トゥーロ星のマッドサイエンティスト・ジャンバ博士に作られた小型モンスターのスティッチは、ハワイのカウアイ島に住む少女リロと仲良く暮らしていた。スティッチはジャンバ博士による626体めの試作品で、実は625もの“いとこ”がいる。やがてそのいとこたち625体のエイリアンの卵が地球に持ち込まれ、スティッチたちと騒動を繰り広げる。

ハワイ中に散らばっていた625の試作品を無事に回収したご褒美として、リロ、スティッチ、ジャンバ、プリークリーは、かねてから望んでいた任務を与えられる。ところが、刑務所を脱走した邪悪なハムスターヴィール博士がジャンバを脅迫し、スティッチそっくりの凶悪なリロイを作らせたことで、リロたちにピンチが訪れる！しかもハムスターヴィール博士は、リロイのクローン軍隊も製造していた！この窮地に助けを求めるリロだが、果たして、宇宙のかなたにいるスティッチたちにSOSは届くのか？そしてそれぞれの場所へと行ってしまった彼らの本当の居場所とは?

キュートな外見とは裏腹にエリートスパイとして活躍するペンギンズは秘密の潜入捜査中、かつて動物園で彼らに人気を奪われたことを恨むタコのデーブに誘拐される。デーブが人間の姿をしたオクト博士に姿を変え、世界中のペンギンへの復讐（ふくしゅう）を計画していることを知ったペンギンズは、スパイ軍団「ノース・ウィンド」と手を組み邪悪な陰謀に立ち向かう。

豊かな大地、プライドランドを統治するライオン、ムファサは、やがては王になる息子のシンバにその心構えを説いていました。しかし、密かに王の座を狙うムファサの弟スカーは、罠をしかけ、王国を奪い取ってしまいます。何も知らないシンバはプライドランドを追われて旅に出ますが、やがてティモンとプンバァに出会い、自分のやるべきことが何か目覚め、ついに宿敵スカーとの対決を迎えるのは『ライオン・キング』の表舞台のお話…！？これを新たにティモンとブンバァの二人が裏舞台で活躍していた部分も編集して『ライオン・キング』の“本当のストーリー！？”をつくってしまった！実はティモンは、ミーアキャット仲間の問題児。「地平線のかなたまで他の動物の土地」と教えるママと、「ミーアキャットはみんなのディナー」と教えるおじさんとは、そりのあわないティモンは、自分の居場所を探しに旅に出発。途中で出会ったブンバァと意気投合し、プライドランドへ向かうのだが、到着した時はまさにシンバの誕生を祝うセレモニーが行われていたのだった…。

フン族の軍勢に苦しむ戦乱の中国。皇帝は各家から一人の兵士を出すように命じる。ムーランは、老いた父親に代わって軍に兵士として加わることを決意。髪を切り名前をビンと変え、勇猛な兵士に変装する。ムーランは過酷な訓練を経て、戦場で目をみはる大活躍を繰り広げる。

原始時代。洞窟から初めて外の世界に飛び出したクルード一家は、天変地異を乗り越え、先史時代よりいる牙を持った獣たちからも無事逃れて生き残ってきた。しかし、今度は“もう1つの家族”との出会い、というかつてない大きな難問に直面する―。

嵐で遭難した英国人夫婦はアフリカの未開地に漂着するが、人食いヒョウの襲撃を受け、赤ん坊を残して殺されてしまう。メスゴリラのカーラに助けられた赤ん坊は、ターザンと名付けられ、ゴリラの群れの一員となった。ターザンは、仲間と姿形の違う自分の出自に悩みながらも、たくましい青年に成長していく。ある日、ターザンはジャングルにやって来たポーター教授の探検隊を目撃するが、やがて教授の娘ジェーンと親しくなっていく。

『ワンス･アポン･ア･スタジオ -100年の思い出-』では、ディズニー・アニメーションの愛されるキャラクターたちが総出演。一堂に集まって、楽しく感動的な再会を果たし、ディズニーの100周年を記念して素晴らしい集合写真を撮る。