本作は連続ドラマとしては初めての「刑事専門弁護士」をメイン題材にした「リーガル・エンターテインメント」作品である。1話完結形式であり、連続ドラマとしては初めて「刑事専門弁護士」に特化したドラマとして制作されたという。タイトルの「99.9」は、日本の刑事事件における裁判有罪率99.9%を意味しており、残された0.1%の無罪を解き明かす弁護士が本作の主人公である。

端爪北斗は両親から壮絶な虐待を受けて育った。 父の端爪至高は順調だった高校までの人生から一転、大学受験の失敗をきっかけに挫折の連鎖が始まる。プライドの高さから一つのところで仕事は長続きせず、転職を繰り返すために生活の貧しさは増す一方だった。うまくいかない人生のストレスを妻の端爪美砂子と息子への暴力で晴らし続けた。 北斗が高校一年生の時に、心身を病んだ父が病気で他界する。母との2人暮らしが始まるが、暴力に依存する母は北斗にわざと自らを虐待させるよう仕向け、北斗は母に暴力を振るってしまう。このままでは母を殺してしまうと思った北斗は、過去に名刺をくれた児童福祉司に連絡する。 児童福祉施設への入所を斡旋された北斗は、そこで里親の近藤綾子を紹介され、綾子との新しい共同生活が始まった。綾子の愛情に触れて北斗は初めて心身ともに安定した日々を過ごす。北斗は高校を卒業し、無事に私立大学へ入学を果たした。ところがほどなくして綾子が末期癌であることが判明。北斗は、綾子の里子の一人で姉のような存在である鞠谷明日実とともに懸命な看病を続けた。 入院中に綾子は、学生時代の友人から癌の治療に効くという「波洞水」を紹介される。癌の治癒への望みを託し、北斗は高額な飲料水「波洞水」を綾子に購入し与え続けた。しかし医学的根拠のない詐欺であったことがわかり、その事実を知った綾子は失意のうちに亡くなってしまう。 綾子の死に打ちひしがれた北斗は、飲料水の開発者への復讐を決意し、オフィスへ向かった。しかしロビーで女性事務員に隠し持っていたナイフに気付かれてしまい、気が動転した北斗は事務員と女性看護師を殺めてしまう。

刑事だった父の後を継ぎ、警視庁捜査一課十一係の刑事となった如月塔子。ある日、廃ビルの地下室で、床にセメントで塗り込まれた死体が発見された。犯人は一体何故こんな殺し方をしたのか？捜査会議が始まり、その最中に「トレミー」と名乗る犯人から捜査本部に電話が入り、塔子が交渉相手となる。殺人に関するヒントを提示しながら警察を愚弄・挑発するトレミー。やがてトレミーから第二の犯行予告の電話が入る。そして予告通り第二の犠牲者が出た。被害者はまたもセメントで塗り固められていた。犯人の動機は？なぜセメントにこだわるのか？被害者に共通するものは？やがて捜査を進めるうち、犯人の本当の狙いが浮かび上がってくる…。

おおよそすべての食べ物には、その魅力を最大限に引き出す「最高の食べ方」がある。 ありそうでなかった、誰もが知りたいおいしい食べ方をレクチャーする新感覚ドラマ。

「金田一少年の事件簿」シリーズ13年ぶりの“連続ドラマ”！ 累計発行部数9000万部を超える原作漫画「金田一少年の事件簿」シリーズは、1992年の連載開始以降、日本にミステリー漫画ブームを巻き起こしました。1995年、堂本剛（KinKi Kids）を主演としてドラマ化され、怪奇的な事件の恐怖感と、巧妙に仕掛けられた謎解きの痛快さが話題に。以来、2001年に松本潤（嵐）が、2005年に亀梨和也（KAT-TUN）が、新たな主演を務め、時代の変化とともに、「金田一少年の事件簿」シリーズは継続されてきました。 そして2013年、4代目として“金田一はじめ”を襲名したのが、Hey!Say!JUMPの山田涼介。 2013年に「香港九龍財宝殺人事件」、2014年1月に「獄門塾殺人事件」と、海外を舞台にした作品を、日本テレビ開局60年特別ドラマとして2年連続で放送。 そして、2014年7月、13年ぶりに連続ドラマとして復活することが決定しました！ 4代目・金田一はじめを支えるメンバーも充実。はじめの幼なじみ・七瀬美雪役には、ドラマ・映画・CM・バラエティと快進撃を続ける、川口春奈。金田一はじめの頼れる後輩・佐木竜二役には、「ヒルナンデス！」のレギュラーとしても活躍の場を広げる、有岡大貴（Hey! Say! JUMP）。はじめが所属するミステリー研究部の部長・真壁誠役には、若手演技派俳優として知られる、浅利陽介。さらに、「金田一」シリーズの名物刑事“剣持警部”が新たに登場します！その役を演じるのは、コメディアン・俳優・司会者・歌手などマルチに活躍する国民的タレント、“ぐっさん”こと山口智充。山口版剣持警部がドラマの世界観に広がりをもたせることは間違いありません！また、剣持警部の部下・畠山高徳役を、北京オリンピック水泳銅メダリストの宮下純一が演じるなど、色とりどりの出演者陣がドラマを彩ります！ 今回のシリーズでは、学園ドラマとしてのはっちゃけた面白さと、「金田一少年の事件簿」ならではの、事件の怪奇的な怖さ、そして、事件のウラに秘められた人間ドラマの重厚さを時代の最先端をゆく華麗な映像技術でお届けします！ ご期待ください！！

名探偵・金田一耕助の孫、金田一一が、幼なじみの七瀬美雪、警視庁の剣持勇警部と様々な難事件を解決する推理ドラマ。決め台詞は「じっちゃんの名にかけて！」、「謎はすべて解けた！」。