警視庁音楽隊カラーガードの雨野小夢（広瀬アリス）は、ある日突然「全領域異常解決室」、通称「全決（ゼンケツ）」への出向を命じられる。神社の社務所のような外観の本部へ行くと、中には室長代理の興玉雅（藤原竜也）がいた。 興玉いわく、「全決」とは大和朝廷時代からある世界最古の捜査機関で、超常現象のような“不可解な事件”を捜査する内閣官房直轄の機関だという。小夢はそんな機関が実在することに驚き、自分がなぜこんな所に配属されたのか不思議に思う。 興玉は、現在捜査している「神隠し事件」について小夢に説明する。最初の事件は半年ほど前に起こった。現場に残されていたのは服と持ち物、そして大量の血液。遺体は見つからず、まるで人間の身体だけが消えてしまったようだ。その後、ネット上に「これは『神隠し』である」「私は神の一柱、ヒルコである」という犯行声明が出た。その後も同じような事件が相次ぎ、ヒルコはその度に声明を発表。人々は徐々にヒルコの存在を信じ、恐れ、中には崇める者もいた。 興玉と小夢は「全決」の局長・宇喜之民生（小日向文世）に指示され、合同捜査に参加するため、警視庁捜査一課へ赴く。捜査一課に到着すると、そこには警部の荒波健吾（ユースケ・サンタマリア）、二宮のの子（成海璃子）、北野天馬（小宮璃央）たちが捜査資料を見ていた。 荒波は興玉たちに怪訝な表情を浮かべながらも、重要人物として捜査している松宮瑠偉（吉村界人）について説明する。松宮は元々、メン地下アイドルグループに所属していたが、解散した後はファンの女性とデートをするなどして稼いでいた。今まで起きた８件の神隠し事件のうち、彼は直近の３件で第一発見者になっており、３人全員が松宮とデートを重ねる熱狂的なファンだった。しかし松宮は犯行時刻にシェアオフィスで働いており、その姿が防犯カメラにも映っていたためアリバイがある。その最初の事件のあと、松宮は「ヒルコが見える」と話すようになり、SNSで大きな話題に。